2016年数理与统计学院组建应用数学系，2023年由于专业发展需要，学院从统计与数据计算系、大学数学系抽调部分骨干教师组建新的应用数学系，重点负责数据计算及应用本科专业、大数据分析微专业的建设以及应用数学本科专业的申报。
目前应用数学系在职教师19人，其中教授4人，副教授7人，讲师8人；具有博士学位的教师18人，另有1位教师在职攻读博士学位。商务统计、统计学硕士导师10人。在职教师中，50岁以上3人，35岁～49岁13人，35岁以下3人。
应用数学系除了负责本科专业建设外，还承担大学1-2年级部分数学课程，研究生的计算方法、数理统计、数学建模、应用数理统计、多元统计分析和统计软件高级编程等课程的教学任务。与应用统计系、大学数学系共同指导学生获得各类竞赛奖项数百项。应用数学系有校三八红旗手1人，市高校青年教师讲课比赛二等奖2人、三等奖2人，校优秀班导师2人。
应用数学系所承担的任务已由单纯的教学转向以教学为主，科学研究与教学研究并驾齐驱。近年来，完成与在研国家自然科学基金面上项目、青年基金项目等国家级项目10余项，合作申请国家自然科学基金项目4项；上海市自然科学基金项目、全国统计科学研究项目等省部级项目3项；合作申请上海市自然科学奖二等奖2项、三等奖1项,校教学成果一等奖1项。松江软课题、上海市青培项目等委办级项目3项。发表论文100余篇，其中SCI收录20余篇。各类教学改革项目等教学研究课程建设项目十余项。
应用数学系是一个充满活力、朝气蓬勃的年轻集体。为了加强教学科研力量，欢迎具有高级以上职称和博士学位、教学经验丰富、具有较高科研水平的统计和计算机方向的老师加入我们的队伍。
应用数学系主任：方涛
应用数学系副主任：李宜阳
